Yığma yapım sistemi ile inşa edilen yapıda malzeme olarak kesme taş kullanılmıştır. Yapım kitabesi bulunmayan yapının 1661-1676 yılları arasında, Fazıl Ahmet Paşa tarafından inşa ettirildiği kabul edilmektedir. Yapıya giriş, güneybatı cephesinde yer alan çift kanatlı, kemerli bir kapı ile sağlanmaktadır. Kapı çevresi kesme taştan söve ile geçilmiştir. Yapı, açık avlulu medrese planına sadık kalınarak inşa edilmiştir. Ortada yer alan şadırvanlı avlu, revaklarla çevrilidir. Avlunun kuzey ve güney yönlerinde, altışar adet birim bulunmaktadır. Doğu yönde yer alan geniş birim, dışa taşırılmıştır. Avluya bakan cephelerde her sütun arası hafif sivri kemerli cam bölmeler ve iki başta hafif sivri kemerli alınlığa sahip dikdörtgen kapılar ile geçilmiştir. Giriş eksenine paralel hatta medreseyi iki tarafta sınırlayan hattın üzeri çift sıra kubbe ile geçilmiştir. Bir kubbe aksı sirkülasyon ve oturma birimi kapsarken diğer kubbe içi özel birimlere ayrılmıştır. Kubbe üzerleri günümüzde sac malzeme ile kaplıdır. Yapı, 1964 yılından beri kütüphane olarak kullanılmaktadır.